12月21日，南京医药就媒体质疑其贱卖资产发布了澄清公告，公告称，南京同仁堂洪泽中药材科技有限公司1.04亿的流动负债主要用于长期股权投资、固定资产采购以及补充流动资金等。

    但这纸澄清公告并不能让质疑平息，有投资者表示，被“贱卖”的资产同仁堂洪泽2011年前3季度新增了9655.76万元负债，投资者根据股权转让公告中的各项数据计算，最终这些负债只转化成了5178.04万元的资产，而扣除公司前3季度的亏损额728万元，同仁堂洪泽还有3749.72万元负债不知道因何发生的。

    但南京医药《2010年度控股股东及其他关联方资金占用情况的专项说明》显示，截至2010年，同仁堂洪泽欠其4482万元，欠款原因为流动资金借款。但南京医药股权转让公告却披露，截至2010年，同仁堂洪泽的流动负债仅为7，818，969.87元。