可以说，《工业转型升级规划》是指导今后五年我国工业发展方式转变的行动纲领，是落实《中华人民共和国国民经济和社会发展第十二个五年规划纲要》的具体部署，也是工业领域其他规划的重要编制依据，而《医药工业十二五发展规划》是其在医药这一细分行业的具体落实。
医药工业规划目标更高
在《工业转型升级规划》中，医药工业属于改造提升的消费品工业范畴。《工业转型升级规划》要求，以品牌建设、品种质量、优化布局、诚信发展为重点，增加有效供给，保障质量安全，引导消费升级，促进产业有序转移，塑造消费品工业竞争新优势。
《工业转型升级规划》明确，医药行业要以提高重大疾病防治能力和提升居民健康水平为目标，加快实现基因工程药物、抗体药物、新型疫苗关键技术和重大新产品研制及产业化，支持利用基因工程、酶工程等现代生物技术改造传统制药工艺和流程。加强化学新药研发及产业化，抓住全球通用名药市场快速增长的机遇，培育国际市场新优势。坚持继承和创新相结合，发展疗效确切、物质基础清楚、作用机理明确、质量稳定可控的现代中药。提高先进医疗装备和高端生物医用材料的发展水平，推进核心技术和关键部件的研发及产业化。促进基本药物生产向优势企业集中，提高生产集约化、规模化水平。推动药品质量标准和生产质量管理规范升级。建立军民结合的应急特需药品研发、生产体系，健全民族药研发及产业化机制，满足应急救治的药物需求。
不仅如此，《工业转型升级规划》对于医药行业还有更高的量化要求：“十二五”期间，医药工业产值年均增速保持在20%以上，高于全部工业增加值年均增长8%的目标要求。
而《医药工业十二五发展规划》从产业规模平稳较快增长、确保基本药物供应、技术创新能力增强、质量安全上水平、产业集中度提高、国际竞争力提升、节能减排取得成效等几个方面，对上述《工业转型升级规划》提出的目标进行了细化分解和具体落实。
例如，就技术创新方面，《医药工业十二五发展规划》要求：建立健全以企业为主体的技术创新体系，重点骨干企业研发投入达到销售收入的5%以上，创新能力明显提高。“十二五”期间获得新药证书的原创药物达到30个以上，开发30个以上通用名药物新品种，完成200个以上医药大品种的改造升级，开发50个以上掌握核心技术的医疗器械品种。这一要求也高于《工业转型升级规划》对全行业所要求的“规模以上工业企业研究与试验发展（R&D）经费内部支出占主营业务收入比重达到1%，重点骨干企业达到3%以上”。
在医药重点发展领域方面，《医药工业十二五发展规划》要求：抓住国内外医药需求快速增长和全球市场结构调整的重大机遇，落实培育和发展战略性新兴产业的总体要求，大力发展生物技术药物、化学药新品种、现代中药、先进医疗器械、新型药用辅料包装材料和制药设备，加快推进各领域新技术的开发和应用，促进医药工业转型升级和快速发展。
据悉，《工业转型升级规划》提出了完善产业政策体系及功能、强化工业标准规范及准入条件、加大财税支持力度等8个方面的保障措施，确保主要目标任务的顺利实现。《医药工业十二五发展规划》则提出，将建立跨部门分工协作、共同推进的工作机制，加强对规划实施的统一领导和精心组织，制定规划实施细则，确保各项任务和措施落到实处。建立规划实施动态评估机制，做好行业运行监测，及时做好发展形势的分析和信息发布，引导产业健康发展。